Keskeinen ero cis-sykloheksaanin ja trans-sykloheksaanin välillä on se, että cis-sykloheksaanin substituentit osoittavat renkaan samalle tasolle, kun taas trans-sykloheksaanin substituentit osoittavat vastakkaisiin tasoihin.
Sykloheksaani on sykloalkaani, jossa kuuden jäseninen hiilirengas esiintyy tuolin rakenteessa. Tuolin rakenteessa tällä yhdisteellä on pienin kulmajännitys; siten se on vakaampi kuin muut mahdolliset konformaatiot. Lisäksi tässä konformaatiossa puolet hiiliatomeihin kytkeytyneistä vetyatomista on renkaan tasossa. Kutsumme tätä ekvatoriaaliseksi paikannukseksi. Toinen puoli sijaitsee kohtisuorassa renkaan tasoon nähden. Kutsumme tätä aksiaaliseksi paikannukseksi. Kun sykloheksaanissa on kaksi tai useampia substituentteja, voimme havaita cis- ja trans-isomerismin tarkkailemalla, ovatko substituentit päiväntasaajan vai aksiaalisessa asennossa.
