Keskeinen ero hydrofobisten ja hydrofiilisten aminohappojen välillä on se, että hydrofobiset aminohapot ovat polaarittomia, kun taas hydrofiiliset aminohapot ovat polaarisia.
Aminohapot ovat proteiinien rakennuspalikoita. Proteiini on jättimäinen polymeerimolekyyli, joka on olennainen osa kaikkia eläviä organismeja. Lisäksi aminohapot ovat pääasiassa kahta tyyppiä välttämättöminä ja ei-välttämättöminä aminohappoina. Lisäksi voimme luokitella ne hydrofiilisiksi ja hydrofobisiksi aminohapoiksi niiden fysikaalis-kemiallisesta luonteesta riippuen. Ne eroavat toisistaan pääasiassa napaisuuden perusteella.
