Keskeinen ero stereokeskuksen ja kiraalisen keskuksen välillä on se, että stereokeskus on mikä tahansa molekyylin kohta, joka voi antaa stereoisomeerin, kun kaksi ryhmää vaihdetaan tässä vaiheessa, kun taas kiraalinen keskus on molekyylin atomi, joka voi antaa enantiomeerin, kun kaksi ryhmää tämä keskusta vaihdetaan.
Kaksi termiä stereokeskus ja kiraalikeskus käytetään usein keskenään, koska kaikki kiraalikeskukset ovat stereokeskuksia; kaikki stereokeskukset eivät kuitenkaan ole kiraalisia keskuksia.
