Tärkein ero - Metabolomiikka vs. metabonomia
Metaboliitit ovat pieniä molekyylejä, jotka osallistuvat metabolisiin reaktioihin soluissa. Metaboliitteihin kuuluvat metaboliset välituotteet, hormonit, sekundääriset metaboliitit, signalointimolekyylit jne. Ne ovat solujen biokemiallisten reaktioiden toimintamolekyylejä. Biologisen näytteen tai yksittäisen organismin täydellinen metaboliittien sarja tunnetaan metabolomina. Metabolome on dynaaminen kokoelma, joka muuttuu joka sekunti kehossa. Metabolomiikka ja metabonomia ovat kaksi termiä, jotka liittyvät organismin metabolomin tutkimiseen. Keskeinen ero metabolomiikan ja metabonomian välillä on se, että metabolomiikka on enemmän huolissaan normaalista endogeenisesta aineenvaihdunnasta ja aineenvaihdunnan profiloinnista solu- tai elinten tasolla, kun taas metabonomia on enemmän metabolisen profiloinnin laajentaminen tiedoilla aineenvaihdunnan häiriöistä ympäristötekijöiden, sairauksien, suoliston vuoksi mikro-organismit ja aineenvaihdunnan profiloinnin vertailu jne. Metabolomiikkaa ohjaa pääasiassa massaspektrometria, ja metabonomia käyttää metaboliittianalyysiin NMR-spektroskopiaa.
SISÄLLYSLUETTELO
1. Yleiskatsaus ja keskeinen ero
2. Mikä on metabolometria
3. Mikä on metabonomia
4. Vertailu rinnakkain - Metabolomiikka vs. metabonomia
5. Yhteenveto
Mikä on metabolometria?
Metabolomiikka on tutkimus aineenvaihduntaprosesseista, joita esiintyy soluissa, biofluidissa, kudoksissa tai organismeissa. Se sisältää solumetaboliittien tunnistamisen ja kvantifioinnin hyvillä analyyttisillä ja tilastollisilla välineillä. Metabolomia pidetään tärkeänä tutkimuksena, koska se paljastaa tietoa organismin aineenvaihdunnasta.
Metabolisten reaktioiden substraattien ja tuotteiden tutkimiseen metabolomiikka käyttää massaspektrometriaa analyyttisenä alustana. Massaspektrometria paljastaa metaboliittien tyypit ja niiden pitoisuudet, mikä heijastaa solujen tai kudosten todellista biokemiallista tilaa. Metabolomiikkaa voidaan siten pitää organismin molekyylifenotyypin parhaana edustajana. Metabolomiikka on organismien pienten molekyylien omistinen tekniikka ja verrataan muihin omisiin tutkimuksiin; metabolomiikka on erittäin tärkeää, koska se heijastaa suoraan solujen biokemiallisen reaktion nykytilaa.
Metabolomia voidaan pitää myös proteomiikan jatkeena, koska niitä syntyy entsyymien, jotka ovat proteiineja, vaikutuksesta, kuten seuraavassa kuvassa on esitetty.
Kuva 01: Metabolomiikka
Mikä on metabonomia?
Metabonomia määritellään kvantitatiivisena mittauksena moniparametrisista metabolisista vasteista tiettyinä aikoina suhteessa patofysiologisiin rasituksiin tai geneettiseen muunnokseen. Tätä sovelletaan yleensä tutkimuksiin, jotka koskevat ihmisten ravitsemusta ja vastauksia lääkkeisiin tai sairauksiin. Tämän lähestymistavan on edelläkävijä Jeremy Nicholson Lontoon Imperial Collegessa, ja sitä on käytetty useilla aloilla, mukaan lukien toksikologia, sairauksien diagnosointi, ravitsemus jne. Historiallisesti metabonomia oli yksi ensimmäisistä menetelmistä, jotka soveltivat systeemibiologian laajuutta tutkimuksiin aineenvaihdunnan.
Metabonomia on enemmän huolissaan biokemiallisten profiilien vertaamisesta kuin yksittäisten metabolisten yhdisteiden tunnistamisesta metabolomiikassa. Siksi metabonomia voidaan määritellä metabolomian osajoukoksi. Siinä korostetaan pääasiassa eri populaatioiden metabolisten profiilien vertailua sairauksien, ympäristöstressien, geneettisen muunnoksen, ravitsemuksen, lääkkeiden jne. Suhteen, koska metaboliitit ovat hyviä merkkejä taudin olosuhteista, huumeiden vaikutuksista, ympäristöstresseistä, altistumisesta toksiinille, jne.
Metabonomisissa tutkimuksissa paljastetaan sekä solunsisäisiä että solunulkoisia metaboliitteja. Se käyttää suuritehoisia tekniikoita analysoimaan suuri määrä metaboliitteja samanaikaisesti ja toistuvasti, mikä mahdollistaa solujen fysiologisen tilan ajallisen tutkimuksen. Se paljastaa myös metaboliittien ja organismin patologisen tilan korrelaation. Metabonomisten tutkimusten tukemiseksi voidaan käyttää genomiikkaa ja proteomiikkaa, koska ne ovat yhteydessä toisiinsa, kuten yllä olevassa kuvassa on esitetty.
Mitä eroa on aineenvaihdunnalla ja metabonomialla?
Erilainen artikkeli keskellä taulukkoa
Metabolomiikka vs. metabonomia |
|
| Metabolomiikka on tutkimus organismin kaikista metaboliiteista | Metabonomia on kvantitatiivinen tutkimus elävien järjestelmien moniparametrisista metabolisista reaktioista ajallisesti patofysiologisiin ärsykkeisiin tai geneettiseen muunnokseen. |
| Päähuolenaihe | |
| Metabolomiikka keskittyy enemmän aineenvaihdunnan profilointiin ja soluissa olevien yksittäisten metaboliittien tunnistamiseen. | Metabonomia keskittyy enemmän metaboliittien tai populaatioiden aineenvaihduntaprofiilien vertailuun suhteessa geneettisiin muunnoksiin, sairauksiin, ympäristöstresseihin, patologisiin ärsykkeisiin, lääkkeisiin jne. |
| Tiedot | |
| Metabolomiikka keskittyy pääasiassa endogeeniseen aineenvaihduntaan. | Metabonomia ei rajoitu endogeeniseen aineenvaihduntaan. Se tarjoaa tietoa sisäisten ja ulkoisten tekijöiden, kuten ruokavalion, toksiinien, sairausprosessien jne., Aiheuttamista aineenvaihdunnan häiriöistä. |
| Analyysityökalut | |
| Se käyttää massaspektrometriaa ensisijaisena analyyttisenä alustana | Metabonomia käyttää NMR-spektroskopiaa tärkeimpänä analyyttisenä alustana. |
Yhteenveto - Metabolomiikka vs. metabonomia
Metabolomi edustaa täydellistä joukkoa soluissa tai organismeissa olevia pieniä molekyylejä, joita kutsutaan metaboliitteiksi. Metabolomiikka on koko metabolomin tutkimus metabolisen profiilin muodostamiseksi. Metabolomiikan avulla tutkijat voivat mitata solun tai organismin todellisen fysiologisen tilan. Metabonomia on osa metabolomiikkaa, joka ulottuu tietojen keräämiseksi elävien järjestelmien moniparametrisista metabolisista reaktioista patofysiologisiin ärsykkeisiin ja geneettisiin modifikaatioihin. Metabonomia ei koske vain yksilöllistä metabolista profilointia, kuten metabolomiikkaa; se vertaa aineenvaihduntaprofiileja muihin tekijöihin, kuten ympäristöstresseihin, sairauksiin, toksiiniin jne. Sekä metabolomiikkaan että metabonomiaan liittyy tutkimuksia eliöiden metaboliiteista solujen todellisen fysiologisen tilan mittaamiseksi. Siten,joskus näitä kahta pidetään synonyymeinä, ottamatta huomioon metabolomiikan ja metabonomian välistä eroa.
