Keskeinen ero etanolin ja bioetanolin välillä on se, että etanoli on orgaaninen yhdiste, joka on johdettu joko kemiallisesta tai biologisesta rutiinista, kun taas bioetanoli on etanolin muoto, joka muodostuu etanolin tuotannon biologisesta rutiinista.
Etanoli tai etyylialkoholi (sama yhdiste, jota löytyy alkoholijuomista) on käyttökelpoinen polttoaineena. Voimme tuottaa sen joko biologisilla tai kemiallisilla keinoilla; jos sitä tuotetaan biologisella menetelmällä, niin kutsumme sitä bioetanoliksi. Bioetanoli on eräänlainen biopolttoaine. Se on hyödyllinen myös bensiinin lisäaineena.