Keskeinen ero moolimassan ja molekyylipainon välillä on se, että moolimassa antaa molekyylin keskimääräisen massan, kun taas molekyylimassa antaa yksittäisen molekyylin massan.
Atomit voivat liittyä yhteen erilaisina yhdistelminä muodostaen molekyylejä ja muita yhdisteitä. Molekyylirakenteet antavat tarkat atomien suhteet; siten voimme kirjoittaa molekyylikaavoja yhdisteille. Nämä ovat tärkeitä määritettäessä molekyylimassaa tai moolimassaa. Voimme luonnehtia molekyylejä niiden massoilla. Tämän tietäminen on todella hyödyllistä laboratoriotyössä, kun mitataan yhdisteitä reaktioiden varalta.