Keskeinen ero fukoidaanin ja fukoksantiinin välillä on se, että fukoidaani on fukoosia sisältävä sulfatoitu polysakkaridi, jota on läsnä ruskea- ja merilevän eri lajeissa, kun taas fukoksantiini on ksantofylli, jota on lisävarustepigmenttinä ruskean levän ja muiden heterokonttien kloroplastissa.
Meriekosysteemit muodostavat sekä kasviston että eläimistön. Niillä on suuri lajien monimuotoisuus. Lisäksi nämä lajit sisältävät erilaisia yhdisteitä, jotka ovat hyödyllisiä ihmisille. Näistä lajeista meriekosysteemeissä uutetut biomolekyylit sisältävät erilaisia terapeuttisia mahdollisuuksia. Fukoidaani ja fukoksantiini ovat kaksi tällaista yhdistettä, joita esiintyy meriekosysteemeissä, pääasiassa ruskolevissä. Vaikka ne eroavat toisistaan kemiallisesti, molempia yhdisteitä käytetään tällä hetkellä erilaisiin tutkimustarkoituksiin niiden potentiaalin tunnistamiseksi terapeuttisina aineina.