Keskeinen ero lapsivesitutkimuksen ja kuorionvillanäytteenoton välillä on se, että lapsivesitutkimuksessa otetaan pieni määrä lapsivesi testattavaksi, kun taas korionvillanäytteenotossa otetaan pieni näyte istukasta testattavaksi.
Amniocentesis ja Chorionic Villus -näytteenotto ovat kaksi synnytystä edeltävää diagnostista menettelyä, jotka määrittelevät tietyt sikiön geneettiset poikkeavuudet. Nämä testit paljastavat geneettiset viat raskauden aikana. Kun geneettisten vikojen riski on korkeampi, lääkärit määräävät korionvillanäytteenoton, kun taas suhteellisen matalan riskin tapauksessa he määräävät lapsivesitutkimuksen. Molemmat testit ovat turvallisia, mutta korionihustestillä on hieman suurempi keskenmenon riski kuin lapsivesitutkimuksella. Lisäksi korionihustesti voidaan suorittaa vähän aikaisemmin kuin lapsivesitutkimus. Raskaana oleva nainen voi harkita joko korionvillanäytteenottoa tai lapsivesitutkimuksen aikana, esimerkiksi jos hänellä on korkean riskin seulontatesti Downin oireyhtymälle, jolla on kokemusta geneettisistä virheistä edellisen raskauden aikana,jolla on yksi tai useampi sukulainen, jolla on geneettinen häiriö, skannaus, joka osoittaa tietyt epänormaalit ultraäänitekijät, tai varmistaa, että lapsella on geneettisiä vikoja jne.